Classification phylogénétique du vivant
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La Classification phylogénétique du vivant est un ouvrage de Guillaume Lecointre et Hervé Le Guyader illustré par Dominique Visset, publié en 2001 aux éditions Belin avec le concours du Centre National du Livre. (ISBN 2-7011-2137-X). La troisième édition revue et augmentée a été publiée en 2006 (ISBN 2-7011-4273-3).
Cette synthèse fait le point sur les récents progrès en matière de classification et propose un arbre phylogénétique des êtres vivants. Ce livre développe aussi les méthodes utilisées pour la réalisation des arbres phylogénétiques.
« Savez-vous que vous êtes plus proche d'un bolet que d'une pâquerette ? Que les crocodiles sont plus proches des oiseaux que des lézards ? Que les dinosaures sont toujours parmi nous ? Que les termes « poissons », « reptiles » ou « invertébrés » ne sont pas scientifiques ? C'est là le résultat des bouleversements de la classification, dont les méthodes ont été totalement repensées au cours des trente dernières années.
Pourtant, ce hiatus de trente ans existe toujours entre ce que l'on apprend à l'école et à l'université et ce qui se fait dans les laboratoires du monde entier. Il est grand temps de changer l'enseignement des sciences naturelles et nos habitudes mentales. La classification moderne, dite phylogénétique, ne met plus l'homme au centre de la Nature. Les groupes d'organismes ne sont plus définis par rapport à lui, mais pour eux-mêmes. Elle est désormais fondée sur un arbre évolutif qui tente de retracer l'histoire de la vie.
Ce livre est une incursion dans l'arbre de la vie. Il n'est ni un précis d'anatomie comparée, ni un précis de zoologie et de botanique, mais il en est le complémentaire. Chaque branche de l'arbre est un groupe comprenant un ancêtre hypothétique et tous ses descendants. On trouvera pour chaque groupe les arguments de la classification, c'est-à-dire les innovations évolutives que l'ancêtre unique à léguées à ses descendants actuels. Bien d'autres renseignements sont fournis (nombre d'espèces, plus ancien fossile connu du groupe, etc.). »
Sommaire |
[modifier] L'arbre de la classification phylogénétique du vivant
On trouvera un arbre beaucoup plus développé, portant les noms latins des taxons, et en mise à jour permanente, annexé à l'article intitulé Arbre phylogénétique.
Ici, il s'agit de la mise ensemble des arbres se trouvant dans le livre, lesquels ne comportent pas les groupes uniquement fossiles. (On peut consulter l'arbre qui avait été proposé dans la première édition de l'ouvrage en suivant ce lien.)
─o le vivant ├─o Eubactéries │ ├─o Protéobactéries │ │ ├─o Protéobactéries ε │ │ └─o │ │ ├─o Protéobactéries δ │ │ └─o │ │ ├─o Protéobactéries α │ │ └─o │ │ ├─o Protéobactéries β │ │ └─o Protéobactéries γ │ ├─o │ │ ├─o Firmicutes │ │ │ ├─o Groupe Bacillus / Clostridium │ │ │ └─o Actinobactéries │ │ └─o │ │ ├─o Cyanobactéries │ │ └─o Groupe Thermus / Deinococcus │ ├─o │ │ ├─o Bactéries vertes sulfureuses │ │ └─o │ │ ├─o Flavobactéries (Cytophagales) │ │ └─o Bactéroïdes │ ├─o │ │ ├─o Spirochètes │ │ └─o Chlamydiales │ ├─o Planctomycétales │ ├─o Bactéries vertes non sulfureuses │ ├─o Aquificales │ └─o Thermotogales │ ├─o Archées │ ├─o Crénarchées │ │ ├─o Thermoprotéales │ │ └─o │ │ ├─o Désulfurococcales │ │ └─o Sulfolobales │ └─o Euryarchées │ ├─o Thermococcales │ └─o │ ├─o Méthanopyrales │ └─o │ ├─o Méthanobactériales │ └─o │ ├─o Méthanococcales │ └─o │ ├─o Thermoplasmales │ ├─o Archéoglobales │ ├─o Halobactériales │ └─o │ ├─o Méthanomicrobiales │ └─o Méthanosarcinales │ └─o Eucaryotes │ ├─o Bicontes │ │ │ ├─o Lignée verte │ │ ├─o Glaucophytes │ │ └─o Métabiontes │ │ ├─o Rhodobiontes │ │ └─o Chlorobiontes │ │ ├─o Ulvophytes │ │ ├─o Prasinophytes │ │ └─o Streptophytes │ │ ├─? Chlorokybophytes │ │ ├─o Klebsormidiophytes │ │ └─o Phragmoplastophytes │ │ ├─o Plasmodesmophytes │ │ │ ├─? Chaetosphaeridiophytes │ │ │ ├─o Charophytes │ │ │ └─o Parenchymophytes │ │ │ ├─o Coléochaetophytes │ │ │ └─o Embryophytes │ │ │ ├─o Marchantiophytes │ │ │ └─o Stomatophytes │ │ │ ├─o Anthocérophytes │ │ │ └─o Hémitrachéophytes │ │ │ ├─o Bryophytes │ │ │ └─o Polysporangiophytes │ │ │ ├─o Lycophytes │ │ │ └─o Euphyllophytes │ │ │ ├─o Moniliformopses │ │ │ │ ├─o Sphénophytes │ │ │ │ └─o Filicophytes │ │ │ └─o Spermatophytes │ │ │ ├─o Ginkgophytes │ │ │ ├─o Pinophytes │ │ │ ├─o Cycadophytes │ │ │ ├─o Gnétophytes │ │ │ └─o Angiospermes │ │ │ ├─o Amborellales │ │ │ └─o │ │ │ ├─o Nymphaeales │ │ │ └─o │ │ │ ├─o Austrobaileyales │ │ │ └─o Euangiospermes │ │ │ ├─o Chloranthales │ │ │ ├─o Cératophyllales │ │ │ ├─o Magnoliidées │ │ │ │ ├─o │ │ │ │ │ ├─o Magnoliales │ │ │ │ │ └─o Laurales │ │ │ │ └─o │ │ │ │ ├─o Canellales │ │ │ │ └─o Piperales │ │ │ ├─o Monocotylédones │ │ │ │ ├─o Acorales │ │ │ │ └─o │ │ │ │ ├─o Alismatales │ │ │ │ └─o Eumonocotylédones │ │ │ │ ├─o Miyoshiales │ │ │ │ ├─o Dioscoreales │ │ │ │ ├─o Pandanales │ │ │ │ ├─o Liliales │ │ │ │ ├─o Asparagales │ │ │ │ └─o Commélinidées │ │ │ │ ├─o Dasypogonales │ │ │ │ ├─o Arecales │ │ │ │ └─o │ │ │ │ ├─o Poales │ │ │ │ └─o │ │ │ │ ├─o Commelinales │ │ │ │ └─o Zingiberales │ │ │ └─o Eudicotylédones │ │ │ ├─o Ranunculales │ │ │ └─o │ │ │ ├─o Sabiales │ │ │ ├─o Proteales │ │ │ ├─o Buxales │ │ │ ├─o Trochodendrales │ │ │ └─o Fonds des tricolpées │ │ │ ├─o Berberidopsidales │ │ │ ├─o Santalales │ │ │ ├─o │ │ │ │ ├─o Dilleniales │ │ │ │ └─o Caryophyllales │ │ │ ├─o │ │ │ │ ├─o Saxifragales │ │ │ │ ├─o Vitales │ │ │ │ └─o Rosidées │ │ │ │ ├─o Crossosomatales │ │ │ │ ├─o Geraniales │ │ │ │ ├─o Myrtales │ │ │ │ ├─o Eurosidées I │ │ │ │ │ ├─o Zygophyllales │ │ │ │ │ ├─o │ │ │ │ │ │ ├─o Celastrales │ │ │ │ │ │ ├─o Malpighiales │ │ │ │ │ │ └─o Oxalidales │ │ │ │ │ └─o │ │ │ │ │ ├─o Fabales │ │ │ │ │ ├─o Rosales │ │ │ │ │ ├─o Cucurbitales │ │ │ │ │ └─o Fagales │ │ │ │ └─o Eurosidées II │ │ │ │ ├─o Brassicales │ │ │ │ ├─o Huertales │ │ │ │ ├─o Malvales │ │ │ │ └─o Sapindales │ │ │ └─o Astéridées │ │ │ ├─o Cornales │ │ │ ├─o Ericales │ │ │ └─o Euastéridées │ │ │ ├─o Euastéridées I │ │ │ │ ├─o Garryales │ │ │ │ └─o │ │ │ │ ├─o Gentianales │ │ │ │ └─o │ │ │ │ ├─o Lamiales │ │ │ │ └─o Solanales │ │ │ └─o Euastéridées II │ │ │ ├─o Aquifoliales │ │ │ └─o │ │ │ ├─o Apiales │ │ │ ├─o Asterales │ │ │ └─o Dipsacales │ │ └─o Zygnématophytes │ │ │ ├─o Chromoalvéolés │ │ ├─o Alvéolobiontes │ │ │ ├─o Ciliés │ │ │ ├─o Dinophytes │ │ │ └─o Apicomplexés │ │ ├─o Straménopiles │ │ ├─o Cryptophytes │ │ └─o Haptophytes │ │ │ ├─o Rhizariens │ │ ├─o Actinopodes │ │ ├─o Foraminifères │ │ └─o Chlorarachniophytes │ │ │ └─o Excavobiontes │ ├─o Euglénobiontes │ ├─o Parabasaliens │ ├─o Métamonadines │ └─o Percolozoaires │ └─o Unicontes │ ├─o Opisthocontes │ ├─o Champignons │ │ ├─o Eumycètes │ │ │ ├─o Chytridiomycètes │ │ │ └─o │ │ │ ├─o Zygomycètes │ │ │ └─o │ │ │ ├─o Ascomycètes │ │ │ └─o Basidiomycètes │ │ └─o Microsporidies │ └─o Choano-organismes │ ├─o Choanoflagellés │ └─o Métazoaires │ ├─? Placozoaires │ ├─o Démosponges │ ├─o Éponges hexactinellides │ ├─o Éponges calcaires │ └─o Eumétazoaires │ ├─o Cnidaires │ ├─o Cténophores │ ├─? Myxozoaires │ └─o Bilatériens │ ├─o Protostomiens │ │ ├─o Lophotrochozoaires │ │ │ ├─o Eutrochozoaires │ │ │ │ ├─o Syndermates │ │ │ │ │ ├─o Rotifères │ │ │ │ │ └─o Acanthocéphales │ │ │ │ ├─? Cycliophores │ │ │ │ └─o Spiraliens │ │ │ │ ├─o Entoproctes │ │ │ │ ├─o Parenchymiens │ │ │ │ │ ├─o Plathelminthes │ │ │ │ │ └─o Némertes │ │ │ │ ├─o Mollusques │ │ │ │ │ ├─o Solénogastres │ │ │ │ │ ├─o Caudofovéates │ │ │ │ │ └─o Eumollusques │ │ │ │ │ ├─o Polyplacophores │ │ │ │ │ └─o Conchifères │ │ │ │ │ ├─o Monoplacophores │ │ │ │ │ └─o Ganglioneures │ │ │ │ │ ├─o Viscéroconques │ │ │ │ │ │ ├─o Gastéropodes │ │ │ │ │ │ └─o Céphalopodes │ │ │ │ │ └─o Diasomes │ │ │ │ │ ├─o Bivalves │ │ │ │ │ └─o Scaphopodes │ │ │ │ ├─o Siponcles │ │ │ │ └─o Annélides │ │ │ └─o Lophophorates │ │ │ ├─o Ectoproctes │ │ │ └─o Phoronozoaires │ │ │ ├─o Brachiopodes │ │ │ └─o Phoronidiens │ │ ├─? Chaetognathes │ │ └─o Cuticulates │ │ ├─o Gastrotriches │ │ └─o Ecdysozoaires │ │ ├─o Panarthropodes │ │ │ ├─o Onychophores │ │ │ ├─o Tardigrades │ │ │ └─o Euarthropodes │ │ │ ├─o Chélicériformes │ │ │ │ ├─o Pycnogonides │ │ │ │ └─o Chélicérates │ │ │ │ ├─o Mérostomes │ │ │ │ └─o Arachnides │ │ │ │ ├─o │ │ │ │ │ ├─o Scorpionides │ │ │ │ │ ├─o Opilionides │ │ │ │ │ └─o │ │ │ │ │ ├─o Pseudoscorpionides │ │ │ │ │ └─o Solpugides │ │ │ │ └─o │ │ │ │ ├─o Palpigrades │ │ │ │ ├─o │ │ │ │ │ ├─o Acariens │ │ │ │ │ └─o Ricinulides │ │ │ │ └─o │ │ │ │ ├─o Aranéides │ │ │ │ └─o │ │ │ │ ├─o Amblypyges │ │ │ │ └─o │ │ │ │ ├─o Uropyges │ │ │ │ └─o Schizomides │ │ │ └─o Mandibulates ou Antennates │ │ │ ├─o Myriapodes │ │ │ └─o Pancrustacés │ │ │ ├─o Rémipèdes │ │ │ ├─o Céphalocarides │ │ │ ├─o Maxillopodes │ │ │ ├─o Branchiopodes │ │ │ ├─o Malacostracés │ │ │ └─o Hexapodes │ │ │ ├─o │ │ │ │ ├─o Protoures │ │ │ │ └─o Collemboles │ │ │ ├─o Campodeoïdes │ │ │ ├─o Japygoïdes │ │ │ └─o Insectes │ │ │ ├─o Archéognathes │ │ │ └─o │ │ │ ├─o Thysanoures │ │ │ └─o │ │ │ ├─o Éphéméroptères │ │ │ └─o │ │ │ ├─o Odonates │ │ │ └─o │ │ │ ├─o │ │ │ │ ├─o Plécoptéroïdes │ │ │ │ ├─o Grylloblattoptères │ │ │ │ ├─o Dermaptères │ │ │ │ └─o │ │ │ │ ├─o Embioptères │ │ │ │ ├─o │ │ │ │ │ ├─o Phasmides │ │ │ │ │ └─o Orthoptères │ │ │ │ └─o │ │ │ │ ├─o Mantoptères │ │ │ │ └─o │ │ │ │ ├─o Blattoptères │ │ │ │ └─o Isoptères │ │ │ └─o │ │ │ ├─o Zoraptères │ │ │ ├─o │ │ │ │ ├─o Hémiptères │ │ │ │ └─o │ │ │ │ ├─o Thysanoptères │ │ │ │ └─o │ │ │ │ ├─o Psocoptères │ │ │ │ └─o Phthiraptères │ │ │ └─o │ │ │ ├─o │ │ │ │ ├─o Coléoptères │ │ │ │ └─o │ │ │ │ ├─o Névroptères │ │ │ │ └─o │ │ │ │ ├─o Rhaphidioptères │ │ │ │ └─o Mégaloptères │ │ │ └─o │ │ │ ├─o Hyménoptères │ │ │ └─o │ │ │ ├─o │ │ │ │ ├─o Trichoptères │ │ │ │ └─o Lépidoptères │ │ │ └─o │ │ │ ├─o │ │ │ │ ├─o Mécoptères │ │ │ │ └─o Siphonaptères │ │ │ └─o │ │ │ ├─o Strepsiptères │ │ │ └─o Diptères │ │ └─o Introvertés │ │ ├─o Nématozoaires │ │ │ ├─o Nématodes │ │ │ └─o Nématomorphes │ │ └─o Céphalorhynches │ │ ├─o Kinorhynches │ │ ├─o Loricifères │ │ └─o Priapuliens │ ├─? Mésozoaires │ └─o Deutérostomiens │ ├─o Échinodermes │ │ ├─o Crinoïdes │ │ └─o │ │ ├─o │ │ │ ├─o Holothuriens │ │ │ └─o Échinoïdes │ │ └─o │ │ ├─o Ophiuroïdes │ │ └─o Astéroïdes │ └─o Pharyngotrèmes │ ├─o Hémichordés │ └─o Chordés │ ├─o Urochordés │ └─o Myomérozoaires │ ├─o Céphalochordés │ └─o Crâniates │ ├─o Myxinoïdes │ └─o Vertébrés │ ├─o Pétromyzontides │ └─o Gnathostomes │ ├─o Chondrichthyens │ └─o Ostéichthyens │ ├─o Sarcoptérygiens │ │ ├─o Actinistiens │ │ └─o Rhipidistiens │ │ ├─o Dipneustes │ │ └─o Tétrapodes │ │ ├─o Lissamphibiens │ │ │ ├─o Gymnophiones │ │ │ └─o Batraciens │ │ │ ├─o Urodèles │ │ │ └─o Anoures │ │ └─o Amniotes │ │ ├─o Mammifères │ │ │ ├─o Monotrèmes │ │ │ └─o Thériens │ │ │ ├─o Marsupiaux │ │ │ └─o Euthériens │ │ │ ├─o Xénarthres │ │ │ └─o Épithériens │ │ │ ├─o Afrothériens │ │ │ │ ├─o Afroinsectiphiles │ │ │ │ │ ├─o Tubulidentés │ │ │ │ │ └─o Afroinsectivores │ │ │ │ │ ├─o Afrosoricides │ │ │ │ │ └─o Macroscélides │ │ │ │ └─o Paenongulés │ │ │ │ ├─o Hyracoïdes │ │ │ │ └─o Téthythériens │ │ │ │ ├─o Proboscidiens │ │ │ │ └─o Siréniens │ │ │ └─o Boréoeuthériens │ │ │ ├─o Euarchontoglires │ │ │ │ ├─o Euarchontes │ │ │ │ │ ├─o Dermoptères │ │ │ │ │ └─o Primates lato sensu │ │ │ │ │ ├─o Scandentiens │ │ │ │ │ └─o Primates stricto sensu │ │ │ │ │ ├─o Strepsirrhiniens │ │ │ │ │ │ ├─o Lorisiformes │ │ │ │ │ │ └─o Lémuriformes │ │ │ │ │ └─o Haplorrhiniens │ │ │ │ │ ├─o Tarsiiformes │ │ │ │ │ └─o Simiiformes │ │ │ │ │ ├─o Platyrrhiniens │ │ │ │ │ └─o Catarrhiniens │ │ │ │ │ ├─o Cercopithécoïdes │ │ │ │ │ └─o Hominoïdes │ │ │ │ │ ├─o Hylobatoïdés │ │ │ │ │ └─o Hominoïdés │ │ │ │ │ ├─o Pongidés │ │ │ │ │ └─o Hominidés │ │ │ │ │ ├─o Gorillinés │ │ │ │ │ └─o Homininés │ │ │ │ │ ├─o Hominines │ │ │ │ │ └─o Panines │ │ │ │ └─o Glires │ │ │ │ ├─o Lagomorphes │ │ │ │ └─o Rongeurs │ │ │ └─o Laurasiathériens │ │ │ ├─o Eulipotyphles │ │ │ └─o Scrotifères │ │ │ ├─o Chiroptères │ │ │ └─o Fereongulés │ │ │ ├─o Périssodactyles │ │ │ ├─o Ferae │ │ │ │ ├─o Carnivores │ │ │ │ └─o Pholidotes │ │ │ └─o Cétartiodactyles │ │ │ ├─o Tylopodes │ │ │ └─o │ │ │ ├─o Suines │ │ │ └─o │ │ │ ├─o Ruminants │ │ │ └─o │ │ │ ├─o Hippopotamidés │ │ │ └─o Cétacés │ │ └─o Sauropsides │ │ ├─o Chéloniens │ │ └─o Diapsides │ │ ├─o Lépidosauriens │ │ │ ├─o Squamates │ │ │ │ ├─o Dibamidés │ │ │ │ └─o │ │ │ │ ├─o │ │ │ │ │ ├─o Pygopodinés │ │ │ │ │ └─o Gekkonidés │ │ │ │ └─o │ │ │ │ ├─o │ │ │ │ │ ├─o Scincidés │ │ │ │ │ └─o │ │ │ │ │ ├─o Cordylidés │ │ │ │ │ └─o Xantusiidés │ │ │ │ └─o │ │ │ │ ├─o │ │ │ │ │ ├─o Serpents │ │ │ │ │ ├─o │ │ │ │ │ │ ├─o Iguanoïdés │ │ │ │ │ │ └─o Leiocephalus │ │ │ │ │ └─o │ │ │ │ │ ├─o Varanidés │ │ │ │ │ └─o │ │ │ │ │ ├─o Anguidés │ │ │ │ │ └─o Helodermatidés │ │ │ │ └─o │ │ │ │ ├─o Teiioïdés │ │ │ │ └─o │ │ │ │ ├─o Lacertidés │ │ │ │ └─o │ │ │ │ ├─o Rhineuridés │ │ │ │ └─o │ │ │ │ ├─o Bipedidés │ │ │ │ └─o │ │ │ │ ├─o Trogonophidés │ │ │ │ └─o Amphisbaenidés │ │ │ └─o Sphénodontiens │ │ └─o Archosauriens │ │ ├─o Oiseaux │ │ │ ├─o Paléognathes │ │ │ └─o Neognathes │ │ │ ├─o Galloanserées │ │ │ │ ├─o Ansériformes │ │ │ │ └─o Galliformes │ │ │ └─o Neoaves │ │ │ ├─o Psittaciformes │ │ │ ├─o Cuculiformes │ │ │ ├─o │ │ │ │ ├─o Strigiformes │ │ │ │ └─o │ │ │ │ ├─o Caprimulgiformes │ │ │ │ └─o Apodiformes │ │ │ ├─o │ │ │ │ ├─o Piciformes │ │ │ │ ├─o Passériformes │ │ │ │ └─o │ │ │ │ ├─o Coliiformes │ │ │ │ └─o Coraciiformes │ │ │ ├─o │ │ │ │ ├─o Ciconiiformes │ │ │ │ └─o │ │ │ │ ├─o Gruiformes │ │ │ │ ├─o Charadriiformes │ │ │ │ ├─o Falconiformes │ │ │ │ ├─o Ardéidés │ │ │ │ └─o Columbiformes │ │ │ └─o │ │ │ ├─o │ │ │ │ ├─o Procellariiformes │ │ │ │ └─o Pélécaniformes │ │ │ └─o │ │ │ ├─o Sphénisciformes │ │ │ └─o │ │ │ ├─o Podicipédiformes │ │ │ └─o Gaviiformes │ │ └─o Crocodiliens │ └─o Actinoptérygiens │ ├─o Cladistiens │ └─o Actinoptères │ ├─o Chondrostéens │ └─o Néoptérygiens │ ├─o Ginglymodes │ └─o Halécostomes │ ├─o Halécomorphes │ └─o Téléostéens │ ├─o Ostéoglossomorphes │ └─o │ ├─o Élopomorphes │ └─o │ ├─o │ │ ├─o Clupéomorphes │ │ └─o Ostariophyses │ └─o │ ├─o │ │ ├─o Argentinoïdes │ │ ├─o │ │ │ ├─o Ésocoïdes │ │ │ └─o Salmonoïdes │ │ └─o │ │ ├─o Osmeroïdes │ │ └─o Stomiiformes │ └─o │ ├─o │ │ ├─o Aulopoïdes │ │ └─o │ │ ├─o Chlorophthalmidés │ │ └─o Alépisauroïdes │ └─o │ ├─o Atéléopodiformes │ └─o │ ├─o Myctophiformes │ └─o Acanthomorphes │ └─o Amoebozoaires ├─o Rhizopodes └─o Mycétozoaires
[modifier] Voir aussi
[modifier] Articles connexes
- Arbre phylogénétique et ses documents annexes :
- Photo-guide taxinomique du monde animal
[modifier] Ouvrages
- Sous la direction de Guillaume Lecointre, Comprendre et enseigner la classification du vivant, Belin , coll. Guide Belin de l'enseignement, 2004. ISBN 2-7011-3896-5
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